Wednesday, November 23, 2022
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जीनोम स्पॉटलाइट: नील चूहा (एविकैंथिस नीलोटिकस)

मैंइसमें कोई आश्चर्य की बात नहीं है कि मॉडल जीवों की सूची में चूहे सबसे ऊपर हैं। वे छोटे और देखभाल करने में आसान हैं, और फिर भी मनुष्यों के साथ समान रूप से साझा करते हैं कि वे शरीर विज्ञान, तंत्रिका विज्ञान और चिकित्सा सहित असंख्य जीवन विज्ञान क्षेत्रों में मूल्यवान अंतर्दृष्टि प्रदान कर सकते हैं। लेकिन सबसे लोकप्रिय कृंतक मॉडल- घर के चूहे (घरेलू चूहा) और नॉर्वे चूहों (रैटस नोर्वेजिकस)—सभी मानवीय गुणों का अध्ययन करने के लिए आदर्श विकल्प नहीं हैं। दोनों प्रजातियां निशाचर हैं और आहार-प्रेरित विकारों के लिए अपेक्षाकृत प्रतिरोधी हैं। और वह, शोधकर्ताओं का कहना है, जहां नील चूहे (एविकैंथिस नीलोटिकस) अंदर आएं।

नील चूहे बहुत अधिक मानव-समान दैनिक कार्यक्रम का पालन करते हैं, सुबह जागते हैं और रात में सोते हैं, जिसका अर्थ है कि वे अध्ययन के लिए बेहतर मॉडल के रूप में काम कर सकते हैं स्वास्थ्य पर पड़ने वाले प्रभाव का सर्कडियन ताल व्यवधान. और प्रजाति चयापचय संबंधी विकारों के लिए भी एक महान मॉडल है: अपने परिजनों के विपरीत, यह पारंपरिक कृंतक चाउ खिलाए जाने पर आहार-प्रेरित मधुमेह विकसित करता है। लेकिन इस तरह के काम को प्रजातियों के लिए जीनोमिक संसाधनों की कमी से बाधित किया गया है- अब तक, यानी 8 नवंबर के पेपर के रूप में बीएमसी जीव विज्ञान प्रजातियों के लिए एक गुणसूत्र-स्तरीय संदर्भ जीनोम की रिपोर्ट करता है।

2.5 जीबी असेंबली का हिस्सा है कशेरुक जीनोम परियोजना, वैज्ञानिकों का एक गठबंधन जो सभी 66,000 मौजूदा कशेरुकी प्रजातियों के लिए लगभग त्रुटि-मुक्त जीनोम अनुक्रम उत्पन्न करने के लक्ष्य को साझा करता है। अत्यधिक सन्निकट अनुक्रम को इकट्ठा करने के लिए, टीम ने मुख्य रूप से PacBio को लगातार लंबे समय तक पढ़ने के लिए नियोजित किया। इस बीच, 10X जीनोमिक्स लिंक्ड रीड्स, बायोनानो का उपयोग करके मचान और जीनोम मैपिंग को पूरा किया गया ऑप्टिकल मानचित्रतथा हाय-सी क्रोमैटिन कैप्चर इल्लुमिना शॉर्ट-रीड सीक्वेंसिंग का उपयोग करना। और न केवल शोधकर्ताओं ने एक व्यक्तिगत चूहे को अनुक्रमित किया, बल्कि उन्होंने अपने माता-पिता दोनों को भी अनुक्रमित किया, जिससे उन्हें माता-पिता के हैप्लोटाइप द्वारा मूल चूहे के एलील को अलग करने की अनुमति मिली। परिणामी अनुक्रम को BUSCO विश्लेषण द्वारा 99 प्रतिशत पूर्ण होने का अनुमान लगाया गया था, जिसका अर्थ है कि अपेक्षित प्रोटीन-कोडिंग जीनों के विशाल बहुमत का हिसाब लगाया गया था।

उच्च गुणवत्ता वाले अनुक्रम ने शोधकर्ताओं को घर के माउस के साथ नील चूहे जीनोम की तुलना करने की अनुमति दी, जीन की खोज की उम्मीद में जो टाइप 2 मधुमेह के विकास के लिए चूहे की असामान्य प्रवृत्ति में योगदान दे सकता है। उनके निष्कर्षों में से एक यह है कि नील चूहे में एंजाइम एमाइलेज के उत्पादन के लिए कम जीन होते हैं, जो कार्बोहाइड्रेट को पचाने में मदद करता है। “हमें लगता है कि नील चूहा उच्च कार्बोहाइड्रेट खाद्य पदार्थ खाने के लिए अनुकूलित नहीं है, जो समझ में आता है क्योंकि वे आम तौर पर अफ्रीका में घास खाते हैं,” सह-लेखक और कैलिफोर्निया विश्वविद्यालय, सांता बारबरा के शोधकर्ता हुइशी तोह कहते हैं। प्रेस विज्ञप्ति. “मुझे लगता है कि यही कारण है कि वे मधुमेह के लिए अतिसंवेदनशील हैं।”

तोह कहते हैं कि टीम अब आहार-प्रेरित मधुमेह से जुड़े ट्रांसक्रिपटामिक परिवर्तनों का अध्ययन करने के लिए जीनोम का उपयोग करना चाहती है और भविष्य में भी एपिजेनेटिक्स का पता लगाने की योजना बना रही है-अध्ययन जो उच्च गुणवत्ता वाले अनुक्रम के बिना असंभव थे। क्षण भर में प्रेस विज्ञप्तितोह ने यह भी आशा व्यक्त की कि जीनोम नील चूहे को व्यापक रूप से अध्ययन किए गए मॉडल जीव के रूप में अपने परिजनों में शामिल होने की अनुमति देगा।

उपविजेता:

एक संबंधित अर्गोनाट (अरगोनाटा हियां) इसके कागजी “खोल” में टक गया

ग्रेटर अरगोनाट (अरगोनाटा अर्गो)

अर्गोनॉट्स को कभी-कभी पेपर नॉटिलस कहा जाता है, क्योंकि नाजुक सुरक्षात्मक मामला महिलाएं अपने अंडों की रक्षा में मदद करने के लिए अपने नॉटिलॉयड चचेरे भाई के गोले के समान होती हैं। हालांकि, प्रजातियों के लिए एक जीनोम, इल्लुमिना शॉर्ट-रीड्स का उपयोग करके बनाया गया और नवंबर के अंक में प्रकाशित हुआ जीनोम जीव विज्ञान और विकास, पता चलता है कि एर्गोनॉट्स की खनिजकृत कृति गोले बनाने के लिए उपयोग किए जाने वाले नॉटिलस की तुलना में जीन के एक पूरे अलग सेट का उपयोग करती है। “यह हमें बताता है कि विकास समान प्रकार की चीजें बनाने के लिए कई अलग-अलग रास्ते ले सकता है,” मैसाचुसेट्स में समुद्री जैविक प्रयोगशाला के एक शोधकर्ता कैरोलिन अल्बर्टिन, जो अध्ययन में शामिल नहीं थे, बताते हैं न्यूयॉर्क टाइम्स. अध्ययन के पीछे जापानी टीम के मुताबिक, “खोल” विकास कई अंतर्दृष्टि में से एक है जिसे अनुक्रम से चमकाया जा सकता है। शिमाने विश्वविद्यालय के सह-लेखक मसा-अकी योशिदा और नेशनल इंस्टीट्यूट ऑफ टेक्नोलॉजी, वाकायामा कॉलेज के डेविन सेतियामार्गा ने कहा, “कई पेचीदा सवालों को संबोधित किया जाना है।” प्रमुखता से दिखाना कागज का। “हम अनुमान लगाते हैं कि अर्गोनॉट्स के जीनोम डेटा की उपलब्धता से हमें न केवल इस प्रजाति को समझने में मदद मिलेगी, बल्कि सामान्य रूप से सेफलोपोड्स और मोलस्क भी।”

मधुमक्खी के सिर पर मधुमक्खी का जूं उड़ता है

एक मधुमक्खी जूँ मक्खी (ब्रौला कोका) मधुमक्खी के सिर पर (एपिस मेलिफेरा)

मधुमक्खी जूं मक्खी (ब्रौला कोका)

मधुमक्खियों और अन्य सामाजिक कीड़ों के घोंसले अक्सर विशेष परजीवियों के घर होते हैं जिन्हें पूछताछ के रूप में जाना जाता है। इन घुसपैठियों में विकसित लक्षण हैं जो दोनों उन्हें कॉलोनी के जीवन के अनुकूल बनाने में मदद करते हैं और जो उन्हें अपने मेजबानों से छिपाने में मदद करते हैं। इस तरह के अनुकूलन के आनुवंशिक आधार को बहुत कम समझा गया है, लेकिन मधुमक्खी जूं मक्खी नामक पूछताछ के लिए एक जीनोम को एक के रूप में प्रकाशित किया गया है। Biorxiv 10 नवंबर को प्रीप्रिंट, इसे सुधारने की दिशा में एक कदम है। शोधकर्ताओं ने परजीवी के 309 एमबी जीनोम को ऑक्सफोर्ड नैनोपोर लॉन्ग-रीड्स के साथ इलुमिना शॉर्ट-रीड्स के साथ जोड़ा। और जब उन्होंने इसकी तुलना इसके मेज़बान मधुमक्खी के जीनोम से की (एपिस मेलिफेरा), उन्होंने “क्रॉस-ऑर्डर जीनोमिक समांतरता के हड़ताली सबूत” देखे, टीम पेपर में लिखती है। उदाहरण के लिए, चयापचय और प्रतिरक्षा में शामिल जीनों में दो प्रजातियों के बीच अभिसरण विकास देखा गया था। और मधुमक्खियों की तरह, मक्खियों ने कड़वा स्वाद रिसेप्टर्स और गंधक रिसेप्टर्स के लिए लगभग सभी जीन खो दिए थे। “ये परिणाम प्रमुख रूपात्मक और न्यूरोएथोलॉजिकल संक्रमणों के अध्ययन के लिए एक नया मॉडल स्थापित करते हैं और संकेत देते हैं कि phylogenetically दूर के जीवों के बीच गहरे आनुवंशिक अभिसरण सामाजिक पूछताछ के विकास को कम कर सकते हैं,” वे निष्कर्ष निकालते हैं।

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