में मेट्रॉइड फ्यूजन, इंटरस्टेलर बाउंटी हंटर सैमस अरन पर रहस्यमय ग्रह SR388 की खोज के दौरान एक एक्स परजीवी द्वारा हमला किया जाता है। यह जीव न केवल घातक है, बल्कि यह किसी भी प्राणी की क्षमताओं की नकल कर सकता है – जिसमें स्वयं सैमस भी शामिल है! एक्स परजीवी के एकमात्र प्राकृतिक शिकारी, मेट्रॉइड डीएनए के जलसेक के कारण कगार से बचाया गया, वह जल्द ही पता लगाती है कि परजीवी SR388 की परिक्रमा करते हुए अनुसंधान केंद्र में फैल गया है। कमजोर और विकल्पों से बाहर, सैमस को बहुत देर होने से पहले एक्स खतरे को नष्ट करने के लिए जो कुछ भी करना चाहिए वह करना चाहिए।